CMDSPACE LABS · SNUBH 1021 테마

00개요

CLAUDE.md 요지

• 원본 data/hf_cohort.csv와 data/original/은 수정하지 않는다. 정리본은 clean/에 새 파일로 쓴다.
• 순서를 건너뛰지 않는다: 품질 점검 → 시간 축 점검(결과가 정해진 뒤 값이 정해지는 변수 금지) → 가정 확인 후 검정. p값만 쓰지 않고 효과 크기와 95% 신뢰구간을 함께 쓴다.
• 코드는 직접 실행해 확인하고, 그림은 figures/에 축 라벨, 단위, n을 넣는다.
• 모든 분석은 notes/analysis-log.md에 덧붙인다(덮어쓰지 않음). 논문 문장의 숫자는 로그에 있는 숫자만 쓴다.
• 인용은 refs.md에 있고 DOI를 확인한 문헌만. 없으면 "추가 확인 필요"로 표시하고 지어내지 않는다.
• 보고 형식: 요약 3줄 → 품질 점검 → 분석 → 그림 제안 → 이 데이터로 답할 수 없는 것.
• 금지: 데이터에 없는 값을 추정해 채우기, 관찰 연구에서 인과 표현, 결측·이상치를 조용히 제외하기.

01흐름

여섯 번의 요청이 일곱 가지 일이 됐습니다. 마지막 요청 하나에 원페이저와 세션 로그가 함께 들어 있습니다.

flowchart LR
  %% @key: B, L
  %% @aux: H
  %% @alt: 여섯 번의 요청이 일곱 가지 일로 이어지고 마지막 두 산출물이 labs 로 올라가는 흐름
  Q["`**01 품질 점검**
정리본 299행`"]
  A["`**02 연관 요인**
Cox 290명 · 사망 93`"]
  W["`**03 구조화 초록**
244단어 · 꼬리표`"]
  D["`**04 결측 결정**
9셀 복원 안 함`"]
  R["`**05 근거 문헌**
refs 2편 · 후보 3편`"]
  B["`**06 원페이저**
CB-006 V1`"]
  L["`**07 세션 로그**
이 페이지`"]
  H["`**labs**
snubh-1021`"]
  Q -->|"clean/"| A
  A -->|"AN-1"| W
  W -->|"미결"| D
  D -->|"Methods"| R
  R -->|"초록"| B
  R -->|"기록"| L
  B --> H
  L --> H

flowchart LR
  %% @key: W
  %% @aux: O
  %% @alt: 원본 CSV 가 정리본, Cox 모형, 분석 로그, 초록, 원페이저로 이어지고 원본 사본은 검증에만 쓰이는 흐름
  S["`**원본 사본**
hf_cohort.csv 302행`"]
  O["`**원자료**
data/original 299행`"]
  C["`**정리본**
299행 · 기록 28건`"]
  M["`**Cox 모형**
290명 · 사망 93`"]
  G["`**분석 로그**
analysis-log · 그림 2장`"]
  W["`**초록**
숫자 48개 대조`"]
  F["`**refs.md**
DOI 확인 2편`"]
  B["`**원페이저**
CB-006`"]
  S -->|"qc_clean.py"| C
  O -->|"검증에만"| C
  C -->|"cox_death.py"| M
  M -->|"결과 기록"| G
  G -->|"로그 숫자만"| W
  F -->|"Background"| W
  W --> B
  G --> B

02프롬프트 원문

사용자가 입력한 그대로입니다. 그림을 확인하는 동안 도구가 보낸 이미지 표시 알림 두 건은 사용자 입력이 아니어서 뺐습니다.

1. P1요청 1

   data/hf_cohort.csv 의 품질을 점검해 주세요. 문제를 유형별 표로 보고하고, 각 문제의 처리 방침과 근거를 제안한 뒤 정리본을 clean/ 에 저장해 주세요.

2. P2

   continue

3. P3

   continue

4. P4요청 2

   정리본으로 추적 기간 중 사망(DEATH_EVENT)과 연관된 요인을 분석해 주세요. 어떤 변수를 넣고 뺐는지 이유를 먼저 말해 주세요.

5. P5요청 3

   analysis-log 에 있는 결과만으로 구조화 초록(Background, Methods, Results, Conclusions)을 250단어 안으로 써 주세요. 숫자마다 로그의 어느 항목에서 왔는지 표시해 주세요.

6. P6

   continue

7. P7요청 4

   되살리지 않고 현재 내용 그대로 명시하며 작성하자.

8. P8요청 5

   초록의 Background 에 들어갈 근거 문헌을 붙여 주세요. refs.md 에 없는 문헌이 필요하면 후보만 제시하고 DOI 확인 전에는 인용하지 마세요.

9. P9요청 6

   두 가지 일을 하자. 하나는 cmds-brief 스킬 사용해서 이 연구에 대한 원페이저 만들어줘. v1 버전으로 진행. 둘은 현재 세션의 wd, prompt, 세션 기록, 산출한 결과물 모두 정리해서 pele 도식과 함께 이해할 수 있는 세션 로그 기록을 html로 만들어줘. 두 개 모두 작업 후 labs 에 업데이트

03세션 기록

요청마다 한 일, 판단과 근거, 실패와 수정을 나눠 적었습니다. 대괄호 꼬리표([QC-1a] 등)는 분석 로그의 항목입니다.

flowchart LR
  %% @key: S4
  %% @aux: R, C
  %% @alt: EF 를 직선으로 넣으면 비례위험이 깨지고 매듭 3개로도 남아 매듭 4개에서 해소된 결정 경로
  R["`**채택 규칙**
매듭 3·4개 모두 0.05 미만`"]
  L["`**EF 직선**
비선형 p 0.003 · PH p 0.021`"]
  S3["`**EF 매듭 3개**
PH p 0.022 · 위반 남음`"]
  S4["`**EF 매듭 4개**
PH 최소 p 0.172`"]
  K["`**주 모형**
13모수 · 모수당 사건 7.2`"]
  C["`**CPK**
매듭 3개 0.954 · 4개 0.031`"]
  R -->|"EF 해당"| L
  R -->|"뒤집힘 → 선형 유지"| C
  L -->|"스플라인으로"| S3
  S3 -->|"매듭 늘림"| S4
  S4 -->|"채택"| K

04결과

품질 점검 — 유형별 처리 [QC-1a]

주 모형 — 보정·비보정 위험비 [AN-1e]

n=290, 사망 93. EF는 제한 3차 스플라인(매듭 4개), 나머지는 선형. 겉보기 C-index 0.760(내부 검증 안 함). 다중 비교 보정 없음(탐색적).

관찰 연구의 연관이며 인과가 아닙니다. 나이, 크레아티닌, EF 25% 대비의 방향과 크기는 민감도 분석 네 가지에서 유지됐고, 빈혈과 고혈압은 모형에 따라 신뢰구간이 1을 넘나들어 결론을 미뤘습니다 [AN-1f].

구조화 초록 — 현재 초안

notes/abstract-draft.md 그대로입니다. 초록 꼬리표는 로그 항목, 회색은 refs.md 인용, 붉은 표시는 아직 근거를 확인하지 않은 자리입니다. 투고할 때 꼬리표는 지웁니다.

05산출물

경로는 작업 폴더 기준입니다. 입력 파일(data/, CLAUDE.md, refs.md, prompts/)은 읽기만 했습니다.

06검증 장치

단계마다 결과를 믿기 전에 확인하는 장치를 하나씩 두었고, 마지막에는 그 장치가 실패를 실제로 잡는지도 확인했습니다.

flowchart LR
  %% @key: N
  %% @alt: 데이터, 분석, 작성 단계마다 둔 검증 장치와 실패를 잡는지 확인한 음성 대조
  H["`**SHA-256**
원본 두 파일 전후 동일`"]
  V["`**원본 대조**
3887셀 · 불일치 0`"]
  F["`**fit() 교차 확인**
lifelines = statsmodels`"]
  P["`**가정 점검**
선형성 · 비례위험`"]
  X["`**check_abstract.py**
숫자 · 단어 · 인용 키`"]
  N["`**음성 대조**
없는 키 · 숫자 오기 → 1`"]
  H -->|"정리"| V
  V -->|"분석"| F
  F --> P
  P -->|"작성"| X
  X -->|"실패를 잡나"| N

• SHA-256: 분석 스크립트를 돌릴 때마다 원본 두 파일의 해시가 그대로인지 확인했습니다 [QC-1].
• 원자료 대조: 정리 규칙에는 쓰지 않고, 정리가 끝난 뒤 셀 단위 검증에만 썼습니다 [QC-1d].
• fit() 교차 확인: lifelines와 statsmodels의 로그가능도 차이가 0.01을 넘으면 멈춥니다 [AN-1c].
• 가정 점검을 코드로: 스플라인 채택 결과가 설계와 다르거나 주 모형에서 비례위험이 깨지면 스크립트가 멈춥니다.
• check_abstract.py와 음성 대조: 일부러 틀린 사본을 넣어 종료 코드 1이 나오는지 확인했습니다 [REF-1].

07남은 일

• 후보 문헌 C1–C3를 Crossref로 확인하고 refs.md에 넣을지 정합니다(사용자 결정).
• 투고 학술지가 초록 안 인용을 허용하는지 확인합니다. 허용하지 않으면 인용을 Introduction으로 옮깁니다.
• 원페이저 CB-006의 해석 문장, 제목, 공개 범위를 결재(G6)합니다.
• 토의 거리: 원 연구는 혈압과 빈혈을 유의한 위험인자로 보고했지만 이번 분석에서는 신뢰구간이 1을 포함했습니다. 차이의 이유는 원 연구 본문을 읽은 뒤에 판단합니다 [REF-1].